Sau báo cáo về các vật thể bay kỳ lạ, di chuyển nhanh của Kenneth Arnold vào mùa hè năm 1947, sự quan tâm đến những "vật thể dạng đĩa" và "đĩa bay" đã lan rộng, và Keyhoe đã theo dõi chủ đề này với một số sự quan tâm, mặc dù ban đầu ông tỏ ra nghi ngờ về bất kỳ câu trả lời phi thường nào cho câu hỏi UFO. Trong một thời gian, True (một tạp chí đàn ông nổi tiếng của Mỹ) đã dò hỏi các quan chức về nghi vấn đĩa bay, với ít ỏi thông tin nhằm thể hiện cho những nỗ lực của họ. Vào khoảng tháng 5 năm 1949, sau khi Không quân Mỹ công bố thông tin mâu thuẫn về những chiếc đĩa này, biên tập viên Ken Purdy liền quay sang nhờ vả Keyhoe, từng viết bài cho tạp chí, nhưng cũng quan trọng là do ông có nhiều bạn bè và mối quan hệ trong quân đội và Lầu Năm Góc.

Sau một số điều tra, Keyhoe đã bị thuyết phục rằng những chiếc đĩa bay là có thật. Vì kiểu dáng, cơ động bay, tốc độ và công nghệ ánh sáng của chúng dường như vượt xa bất kỳ sự phát triển nào của quốc gia, Keyhoe đã bị thuyết phục rằng chúng phải là sản phẩm của trí thông minh phi thường, và chính phủ Mỹ đang cố gắng giữ kín toàn bộ sự thật về chủ đề này. Kết luận này đặc biệt dựa trên phản hồi mà Keyhoe tìm thấy khi ông hỏi các quan chức khác nhau về đĩa bay. Ông được cho biết không có gì với chủ đề này, nhưng đồng thời bị từ chối tiếp cận nguồn tài liệu liên quan đến đĩa bay.

Bài viết "Flying Saucers Are Real" (Những chiếc đĩa bay là có thật) của Keyhoe đã xuất hiện trên tạp chí True số tháng 1 năm 1950 (xuất bản ngày 26 tháng 12 năm 1949) và gây ra một sự náo động. Mặc dù những giả thuyết như vậy luôn khó kiểm chứng, Đại úy Edward J. Ruppelt, người đứng đầu Dự án Blue Book đầu tiên, cho biết "Có tin đồn giữa các nhà xuất bản tạp chí rằng bài viết của Don Keyhoe trong True là một trong những bài viết đăng trên tạp chí được đọc và thảo luận rộng rãi nhất trong lịch sử."

Tận dụng sự quan tâm này, Keyhoe đã mở rộng bài viết thành một cuốn sách, The Flying Saucers Are Real (Đĩa bay là có thật) (1950); nó đã bán được hơn nửa triệu bản bìa mềm. Ông lập luận rằng Không quân biết đĩa bay có nguồn gốc ngoài Trái Đất, nhưng đã hạ thấp các báo cáo để tránh sự hoảng loạn của công chúng. Theo quan điểm của Keyhoe, người ngoài hành tinh — bất kể nguồn gốc hay ý định của họ — dường như không thù địch, và có khả năng đã giám sát trái đất trong hai trăm năm trở lên, mặc dù Keyhoe đã viết rằng "sự quan sát của họ đột nhiên tăng lên vào năm 1947, sau loạt vụ nổ bom A năm 1945." Tiến sĩ Michael D. Swords đã mô tả cuốn sách là "một tài liệu khá giật gân nhưng chính xác về vấn đề này." (Swords, tr. 100) Boucher và McComas đã ca ngợi tác phẩm này đưa ra "lập luận vững chắc, tài tình và có sức thuyết phục."[8]

Keyhoe đã viết thêm một vài cuốn sách về UFO. Flying Saucers from Outer Space (Đĩa bay từ ngoài vũ trụ) (Holt, 1953) có lẽ là ấn tượng nhất, chủ yếu dựa trên các cuộc phỏng vấn và báo cáo chính thức được Không quân hiệu đính. Cuốn sách bao gồm một lời giới thiệu của Albert M. Chop, thư ký báo chí của Không quân ở Lầu Năm Góc, người đã mô tả Keyhoe là một "phóng viên đúng đắn, có trách nhiệm" và tiếp tục bày tỏ sự tán thành thận trọng đối với các lập luận của Keyhoe nhằm ủng hộ giả thuyết ngoài Trái Đất. Những lời chứng thực như vậy chỉ củng cố niềm tin được một số nhà thừa nhận, rằng các thông điệp hỗn hợp của Không quân về UFO là do che đậy.

Carl Jung cho rằng hai cuốn sách đầu tiên của Keyhoe "dựa trên tài liệu chính thức và cẩn thận tránh những suy đoán lung tung, ngây thơ hoặc định kiến ​​về các ấn phẩm [UFO] khác."[9]

Những người khác không đồng ý với đánh giá của Keyhoe. Trong cuốn sách năm 1956 của mình, Edward J. Ruppelt đã viết, "Không quân không cố che đậy", và tuyên bố rằng "Vấn đề đã được giải quyết với sự nhầm lẫn có định hướng". Cuốn sách của Ruppelt chỉ ra rằng Ruppelt vẫn giữ một số quan điểm mờ nhạt về Keyhoe và các tác phẩm ban đầu của ông; Ruppelt lưu ý rằng mặc dù Keyhoe thường có sự thật thẳng thắn, nhưng cách giải thích của ông về các sự kiện hoàn toàn là một câu hỏi khác. Ông ấy nghĩ Keyhoe thường kịch tính hóa tài liệu và cáo buộc Keyhoe "đọc lén" những gì ông và các sĩ quan khác đang nghĩ. Tuy nhiên, Keyhoe đã trích dẫn các cuộc trò chuyện với Ruppelt trong các cuốn sách sau này, cho thấy Ruppelt đôi lúc có thể khuyên bảo Keyhoe.